專利申請代理費是指企業為委托專利代理機構代理自己申請專利所支付的費用。該費用在企業的財務會計中，應該計入相關的科目。本文將針對專利申請代理費計入什么科目問題進行深入探討。

首先，從財務會計角度考慮，專利申請代理費應該計入費用類科目當中。一般來講，該費用可劃分到研發費用、知識產權費用等科目中。這種劃分方式具有一定的靈活性，企業可以根據自身情況和需求進行調整。

其次，從會計準則角度考慮，根據《企業會計準則》（以下簡稱“會計準則”）相關規定，專利申請代理費應該計入研發費用科目。會計準則規定，企業為獲得今后經濟利益而支付的研發費用應當計入期間費用，這也包括專利申請代理費。

此外，在稅務方面，專利申請代理費也有相應的稅務處理。根據國家稅務總局公告，專利申請代理費按照15%的稅率計征企業所得稅。具體來說，專利申請代理費應當計入企業的費用，然后在企業所得稅計算中予以扣除。

綜上所述，專利申請代理費計入什么科目的問題，在財務會計層面上應該計入費用類科目，包括研發費用、知識產權費用等科目中。在會計準則和稅務方面，專利申請代理費應該計入研發費用科目，并按照15%的稅率計征企業所得稅。企業在處理該費用賬務時，需要根據自身情況和需求，靈活劃分相關科目，以便更好地管理和運營企業。